L'ordre Interseca l'alfa amb la selecció crea una selecció a partir dels canals alfa combinats de totes les capes seleccionades, que s'intersequen amb la selecció ja existent. Només es conserven parts comunes d'ambdues seleccions.

Les zones opaques estan totalment seleccionades, les zones transparents no estan seleccionades i les zones translúcides estan parcialment seleccionades. No s'han canviat els canals alfa de les capes seleccionades.