Анимация может содержать несколько слоёв, поэтому её размер может быть важен. Для страниц интернета важно уменьшить размер. Фильтры оптимизации позволяют уменьшить этот размер. Много элементов общие между всеми слоями анимации, поэтому их можно сохранить только раз вместо сохранения в каждом слое, и для каждого слоя сохранить только изменения.

GIMP предлагает два фильтра оптимизации: Оптимизировать (Разница) и Оптимизировать (GIF). Результаты их работы не слишком отличаются.

In this animation, the red ball goes downwards and past vertical bars. File size is 600 kB.

File size moved to 153 kB. Layers held only the part the background which will be used to remove the trace of the red ball. The common part of layers is transparent.

File size moved to 154 kB, a bit bigger in the present example, but layer size has been reduced. Layers held only a rectangular selection which includes the part of the background which will be used to remove the trace of the red ball. The common part of layers is transparent.

Фильтр «Разоптимизировать» удаляет все оптимизации по-слойной анимации. Эта команда полезна, когда надо редактировать анимацию, но по тем или иным причинам не хочется отменять сделанные изменения и начать с исходного изображения.