Het dialoogvenster Voorkeuren kan worden geopend vanuit het hoofdmenu, met Bewerken → Voorkeuren. Het laat u veel aspecten aanpassen voor de manier waarop GIMP werkt. De volgende gedeelten behandelen in detail de instellingen die u kunt aanpassen en wat zij beïnvloeden.

Alle informatie voor Voorkeuren is opgeslagen in een bestand, genaamd gimprc in uw map voor de configuratie, dus als u een “gevorderde gebruiker” bent, die liever werkt met een tekstbewerker dan een grafische interface, kunt u voorkeuren wijzigen door dat bestand te bewerken. Als u dat doet, en u werkt op een systeem van Linux, dan zal man gimprc u heel veel technische informatie geven over de inhoud van het bestand en waar die voor wordt gebruikt.